亚马逊云科技助力科学家发现13万种新RNA病毒

林月 2022-03-09 12:47:47
行业观察 2022-03-09 12:47:47 阅读 1386 评论 0

3月9日消息,据报道,亚马逊云科技宣布近期与加拿大不列颠哥伦比亚大学云创新中心(UBC CIC)达成合作,基于亚马逊云科技构建的超级计算平台,助力国际科学家团队在11天内搜索了近600万份公开可用的生物样本,成功识别出超过13万种新的RNA病毒,其中包括9种新型冠状病毒。

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据了解,在亚马逊云科技助力下,UBC CIC团队和全球计算病毒学家启动了The Open Virome(开放病毒组)项目,创建了开放的病毒发现云计算平台Serratus。目前,该研究成果已经发表在科学杂志《自然》上,同时还创建了公开的病毒数据库,向全球科学界分享研究成果,帮助加速对RNA病毒的研究。

据介绍,The Open Virome项目的研究人员仅用8周时间,顺利地在亚马逊云科技上构建超级计算平台。借助亚马逊云科技弹性计算能力,他们能够快速处理数百万GB的数据。该团队在亚马逊云科技Amazon Simple Storage Service(Amazon S3)中镜像了病毒基因测序数据库SRA,之后使用亚马逊云科技弹性计算云实例Amazon Elastic Compute Cloud(Amazon EC2)来分析数据集。

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最终,在11天内,该团队处理了高达570万个测序数据集,仅花费了2.4万美元,发现了13万个新的RNA病毒。在此之前,科学家们经过几十年的数据分析,只发现了1.5万种病毒。

另外,通过基于亚马逊云科技搭建的Serratus平台,研究人员相信他们既能识别潜在的有害新病毒,又能提醒科学家注意导致新冠肺炎病毒SARS-CoV-2 virus的潜在突变,帮助改善诊断测试和疫苗开发,为医疗政策决策者提供更有效的指导。

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(图源UBC官网)

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